Yuni Shara sudah dua kali menikah, dimana yang pertama dengan Raymond Manthey pada tahun 1993 dan hanya bertahan selama 4 bulan.
Ia kembali menikah untuk kedua kalinya dengan Henry Siahaan pada tahun 1997.
Pernikahannya dengan Henry baru disahkan pada tahun 2002 di Perth, Australia.
Kakak Krisdayanti itu dikaruniai dua orang anak bernama Cavin Obient Salomo Siahaan, dan Cello Obient Siahaan.
Namun sayangnya pada tahun 2007, Henry Siahaan diduga terlibat dalam kasus korupsi yang membuatnya harus masuk jeruji besi.
Yuni kemudian mengajukan cerai kepada suaminya setahun kemudian, dan resmi berpisah pada tanggal 17 Juni 2008.***